非小细胞肺癌药物干预de相关研究 | 外泌体
又到周末啦，每周固定的外泌体方案专题来了，前几期方案专题都有小伙伴索要原文，这个可是我们高级技术支持的倾力之作，目前文章还没有发表。有想咨询这方面问题的小伙伴可以留言或者直接联系小编，小编定会为你排忧解难的哈~
非小细胞肺癌的研究 肺癌是目前癌症死亡率最高的疾病，非小细胞肺癌（NSCLC）约占肺癌的85%。通过成瘤型，非小肺癌能够分为腺癌，鳞状细胞癌，大细胞癌三类。目前有关于非小细胞肺癌的研究集中在肺癌组织的基因组和转录组的研究，通过全基因组，全外显子测序，以及目标区域等测序策略，研究人员确定了有关非小肺癌的发生与发展的驱动基因，如EGFR，KARS，TP53等。
目前在非小细胞肺癌中缺乏早期鉴定的普遍性的biomarker，同时更为有效的治疗手段和方案也相应缺乏。近期的文章表明，外泌体以及外泌体中的miRNA可能能成为新型的检测工具。
通过确定胸积液外泌体小RNA表达模式，对非小细胞肺癌耐药性及治疗干预机理的探究。
1、方案概述
对不同治疗效果的病人胸腔进行外泌体小RNA的高通量分析，分析出在不同治疗效果的病人中有明显差异的外泌体miRNA，之后经过靶基因预测以及GO、KEGG分析，找出与在非小细胞肺癌耐药性的相关基因，后期通过验证以及相应的细胞模型实验，找出非小细胞肺癌在表观遗传上的耐药机理。
2、技术路线
图1 技术路线图
样品的选择上面有俩个方案可供选择
a：如技术路线当中所提示的，对于耐药性的研究中，需要选择同一种药物治疗下，对效果有差异的病例进行胸积液的外泌体小RNA测序，其中病例样本建议选择“极端”样本，即：治疗效果非常好的病例，几乎没有治疗效果的病例。从这个思路可以找到NSCLC相关的耐药机制研究；
b：建议在以上基础上加入以上样本中未治疗时的胸积液外泌体的小RNA测序，有以下目的：
①通过对未治疗的样本进行检测，能够扣除掉个体背景中特异的表现出的miRNA，减少与药物治疗无关的miRNA的干扰。
②对不同NSCLC的治疗前的样本进行对比，能够找到早期NSCLC外泌体miRNA，之后扩大样本，进行qPCR检测，能够了解到该外泌体miRNA与预后之间的相关性，从而证实外泌体中miRNA的biomarker作用。
生物信息学分析主要有：miRNA表达差异分析，差异表达miRNA聚类分析，差异表达miRNA靶基因的GO功能富集分析及KEGG通路富集分析，新miRNA预测以及一些个性化分析，如已知miRNA保守性分析、蛋白互作网络分析等。
重要的生物信息分析举例——差异基因KEGG富集性分析
图2 KEGGpathway通路图
今天的外泌体方案就介绍到这里咯，往期方案请查看下方的相关阅读。
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